【领导名录】
总  队  长：那顺巴雅尔（蒙古族）
第一 政 委：宋建中（7月任职）
政      委：章文权（蒙古族）
副总 队 长：汪旭东
           张俊
副  政  委：孟卫
参  谋  长：高连斌
政治部主任：陈怀树
后 勤 部长：苏雅拉图（蒙古族）
后勤部政委：阿木尔图（蒙古族）
【体制调整】2001年是改进公安边防部队领导管理体制的一年。4月24日至25日，自治区召开全区公安边防工作会议，传达贯彻全国公安边防工作会议精神和中组部、中政委、公安部党委联合下发的《关于改进公安武警边防部队领导管理体制的通知》精神，研究落实改进全区公安武警边防部队领导管理体制工作。按照党中央的指示精神，坚持“双重领导，条块结合，以条为主”的原则，对自治区公安武警边防部队领导管理体制进行调整，进一步明确部队建设、边防工作的领导职责和党组织关系。自5月1日起，部队组织人事关系及干部档案从公安厅政治部现役干部部门移交公安边防部队管理。自治区公安厅分管边防工作的副厅长宋建中兼任内蒙古公安边防总队党委第一书记、第一政委。
【目标化管理】各级部队始终坚持把总队党委制定的工作任务和责任目标作为一条主线，贯穿于全年工作的各个阶段和部队建设的全过程。年初，总队党委按照公安部边防局下发的《公安边防工作要点》，认真分析研究，紧密结合自治区工作实际，确定全年主要任务和工作目标，并以电话会议形式进行部署，兑现2000年度工作责任目标奖惩。之后，采取总队领导和司令部、政治部、后勤部领导包片负责全区东、中、西部地区部队工作落实及完成情况的办法，组成工作组分头深入基层，与各边防支队、边检站和呼和浩特公安边防指挥学校签订《2001年工作目标责任书》，对各单位工作安排与部署情况进行面对面的具体检查指导。各部门、各基层部队按照总队党委的工作部署，把健全和完善目标责任制作为主要工作步骤，进一步分解量化工作责任目标，做到层层签订，横向到边，纵向到底，人人有责，并按季度或按月制定出详细的工作进度表，把具体责任和目标逐一落实在每一名官兵肩上，充分调动广大官兵的工作积极性。
【边境管理】1月8日，由边防总队起草制定的《〈内蒙古自治区边境管理条例〉实施细则》颁布实施，为自治区边境管理工作和行政执法提供具体的法律依据。各级部队在进一步强化基层基础业务工作的同时，紧紧抓住维护稳定这一根本任务，坚持“以打促防，打防并举”的工作思路，深入持久地开展以“治爆缉枪”、“扫黑除恶”、清查“两口一屋”和破大案、追逃犯为主要内容的“严打整治”专项斗争，取得了显著战果。年内自治区边境地区共发生刑事案件427起，破案342起，其中重大案件发90起，破案79起。与上年相比，破案绝对数分别提高65.2％和19.7％；受理治安案件424起，查结394起，查结率为92.9％；挖出隐案49起；打掉犯罪团伙18个；收缴违法枪支111支；抓获各类在逃犯41人，进一步净化了边管区的治安环境。在呼和浩特召开全区部队业务工作研讨会，研究分析近几年全区公安边防工作面临的形势和出现的新情况、新问题，明确今后一个时期业务工作措施与重点，并结合公安边防工作特色把“严打整治”斗争引向深入，及时开展反偷渡、反走私、清边整治统一行动，截获边境偷渡案件33起149人，抓获“蛇头”12人，为历年之最；查获走私案件12起，案值47万余元；发生蒙古国人员越界盗赶牲畜案件9起，被盗牲畜67头（匹、只），与上年相比，起数与头、只数分别下降30％和92.8％，蒙古国人员越入自治区境内盗抢牲畜案件得到了初步治理。坚持把维护边境社会政治稳定摆在首位，进一步强化对社会面的控制，及时发现并取缔各类非法宗教活动与邪教组织10起180人，查获“法轮功”书籍、传单、光盘等非法宣传品1 000余份，配合当地有关部门及时制止群体性事件4起160余人。
【边防检查】各边防检查站深入贯彻全国陆地口岸规范化建设满洲里现场会精神，认真落实边防检查“两个规范”，完善处突预案，健全和实行领导岗位责任制，狠抓查控工作，切实增强了口岸把关能力，做到查控工作万无一失。年内，全区各口岸共检查出入境人员191万余人次，与上年相比增长7.13％；检查出入境交通运输工具23万余辆（列、架）次；查处违法违规人员3 241人次，与上年相比减少69.83％；查获口岸偷渡案件19起61人，比上年起数和人数分别下降了82.73％、49.17％；查获边控对象60人，确保了口岸安全，维护正常出入境秩序。
【政治工作】年内，考核配备各级领导班子141个，提任团职干部79人、营职干部330人，接收地方院校大学生64人，复转安置干部48人，进一步改善干部队伍结构，增强班子活力，促进竞争激励机制的形成。组织部队认真学习邓小平理论、江泽民总书记“三个代表”重要思想、“七一”重要讲话和党的十五届六中全会精神，加强党对军队绝对领导教育和时事政策教育，增强广大官兵坚持党的基本路线、践行“三个代表”的自觉性。进一步提高广大官兵依法文明执勤、办案水平，激发官兵爱岗敬业和无私奉献精神，有力地加强广大官兵的思想作风建设。在认真抓好经常性思想教育工作的基础上，组织开展庆祝建党80周年一系列庆祝活动，对全区部队24个优秀党支部、37名优秀党员、10名优秀党务工作者进行表彰，进一步激发广大官兵“体党情、感党恩、跟党走”的爱党热情，坚定实践“三个代表”的政治信念。
【精神文明建设】年初，总队组织召开了呼和浩特地区“双拥”共建工作座谈会，进一步深化“双拥”共建活动内容。全区部队积极参加驻地双拥模范城创建活动，纷纷走上街头开展宣传和便民服务活动，为群众办实事、办好事，参加义务植树等公益活动。有的单位坚持常年为驻地党政机关担负升国旗礼宾仪仗队任务，有的成立威风锣鼓队义务为地方重大庆典活动服务，有的主动承担起街道、广场卫生清洁工作，有的在营区设立了警民文化站、邮政代办点，有的资助多名失学儿童重返校园，有的帮扶贫困农牧民春耕生产，还有的单位担负起为驻地附近大中专院校和中小学军训的任务。总队机关年内完成兴安盟白音特布新艾里定点帮扶任务，受到自治区扶贫办的表扬；在继续做好与呼市保合少乡共建社会主义精神文明工作的同时，与内蒙古工业大学商学院新建共建对子。年内全区部队广大官兵为灾区和贫困地区捐款23.4万元，捐物价值30余万元，资助失学儿童104名。特别是2001年冬春季节全区大部分边境地区都不同程度地遭受历史上罕见的雪灾，全区部队积极主动地加入到抢险救灾行列中，投入警力5 000余人次，抢救被风雪围困的群众1 000余人安全脱险，帮助灾区寻找暴风雪中走失的牲畜30 000余头（只），为牧民挽回经济损失近千万元，部队“双拥”共建工作有了新的发展。年内，又有阿盟边防支队、满洲里边检站、呼和浩特边防指挥学校等4个单位进入自治区级文明单位和标兵单位行列。
【部队管理】认真贯彻落实公安部边防局下发的《机关正规划管理若干规定》和《信息化建设三年总体规划》，8月，在阿盟边防支队及时召开全区部队机关正规划管理现场会，明确抓机关、促基层的工作指导思想，通过规范各级机关办公秩序，推动部队正规划建设和信息化建设的步伐。这一做法，走在全国公安边防部队的前列。与此同时，坚持依法治警、从严治警的方针，始终把贯彻执行条令条例摆在部队建设的首位，组织全区部队开展“条令条例学习月”活动和驾驶员队伍教育整顿及治理刑讯逼供、滥用枪支警械具、滥用强制措施等工作，结合开展“条令条例及人民警察法知识竞赛”活动，有效地强化经常性管理教育工作。特别是始终将安全防事故工作贯穿于全年各项工作的始终，紧紧抓住“人、车、枪、酒”等几个重点环节，严格防范措施与规章制度，并根据下半年安全工作实际，组织实施“百日安全无事故竞赛”活动，使全区部队掀起抓工作、促落实、保安全的工作热潮，安防工作取得明显成效，有力地保证部队的安全稳定。
【后勤保障】是年，各级领导和机关坚持面向基层、服务于基层的指导思想，以公安部边防局为期三年大抓基层建设为契机，不断加大对基层建设的投入，为基层办许多实事，进一步提高后勤保障能力，及时地解决基层吃水、照明、交通、营建和重大病号医疗费超支等问题。为全区部队装备车辆47辆，为兵员集中的工作站、中队配发给养器材325台（件），为9个单位新建加油站并配发储油设备、35个基层单位新建温室大棚、49个所站新建和翻建了营房、17个单位购置更新锅炉、30个单位打深水井、8个单位架设长电、50个基层单位建卫生室、12个团级单位更新程控总机并配备数字电话会议系统、15个边防大队安装数字集团电话，完成总队至各团级单位的综合业务数字网工程建设，为满洲里边防检查站口岸执勤现场安装监控系统，使基层工作生活条件得到进一步改善。在加大对下投入、加快建设步伐的同时，各级还狠抓科学管理，加强监督检查，提高经费和装备的使用效益。